温度控制电路板
仪器温度参数在色谱工作站或者仪器面板上设置后，下发到温度控制板上，仪器开始执行该参数，进行升温或者降温。
气相色谱仪分析系统的温度控制电路板上具有进行控温的电路模块和控制器等，一般而言，在进行加热升温过程中，可控硅指示灯会持续闪烁，表示仪器在进行升温控制。
非柱温箱升温和降温指的是进样口、检测器和转化炉等部件。
气相色谱在进样口、检测器等部位一般使用加热棒+铂电阻，升温时利用220V交流电（亦有采用24V直流）在加热棒（高阻值）上产生热量，通过铂电阻（PT100）对温度进行测量和反馈，使进样口、检测器等部位达到设定温度。
降温时，加热棒停止加热，进样口、检测器等部位自然冷却或者通过小风扇吹风冷却。
气相色谱柱温箱一般使用加热丝+铂电阻，升温时利用220V交流电在加热丝上产生热量，通过铂电阻（PT100）对温度进行测量和反馈，使进样口、检测器等部位达到设定温度。
另外，柱温箱内部挡风板之后安装有风扇，通过风扇的转动和混匀作用，可以将加热丝产生的热量均匀分布在柱温箱内，保持柱温箱内具有合适的温度梯度。其工作的简单示意图如下，下左图为柱温箱风扇和加热丝的相对位置，下右图为升温和恒温时，柱温箱内部的气体流动方向
早期的气相色谱柱温箱在需要降温时，通过人工手动开启柱温箱门来实现，待温度降到指定温度后，关闭柱温箱门即可。
目前在线气相色谱分析系统的色谱柱温箱在程序升温结束恢复到初始较低温度，或者需要降温时，通过仪器自动实现。其主要实现机构主要为柱温箱内部的风扇和仪器后部的降温通道（俗称“后开门”结构）。
仪器开始降温时，柱温箱后部的降温通道（俗称“后开门”结构）在电机带动下开启，热风从上部出口吹出，冷风从下部进口进入，通过冷热交换，仪器柱温箱迅速降温；待温度达到接近指定温度，“后开门”结构短暂的反复进行开合关闭，对温度进行细调；温度达到指定温度后，“后开门”结构完全关闭。