反控气相色谱仪的温控系统用于设定、控制和测量色谱柱箱、检测室和汽化室三处的温度。气相色谱的流动相是气体，试样仅在气态时才能被载气携带通过色谱柱。因此，从进样到检测完毕都必须控温。同时，温度也是气相色谱分析的重要操作参数之一，它直接影响色谱柱的选择性、分离效率和检测器的灵敏度及稳定性。在现代气相色谱仪中，色谱柱箱、检测室和汽化室都有独立的恒温控制装置，各加热区之间都用隔热材料相对隔开，使各加热区之间的热传递减至最小。通常采用可控制硅温度控制器，其性能可靠，控温连续，精度高，数字显示，操作简便。柱箱的使用温度一般为室温~400，箱内上下温差低于3，控温精度低于0.1，配有后开门自动降温系统。色谱柱的温度控制方式分为恒温和程序升温两种。